Kubilay Anadolu İmam Hatip Lisesi, ismini aldığı asıl mesleği öğretmen olan ve asteğmen olarak görevini yaparken 23 Aralık 1930'da şehit edilen Mustafa Fehmi Kubilay'ın ölümünün 35. yılı anma günü olan 23 Aralık 1965'de Malatya Kubilay Ortaokulu olarak eğitim ve öğretime başlamıştır.

             Bakanlığımızın 16 derslikli L tipi projeli okulu olup 1980-1981 öğretim yılında  lise kısmı açılarak Kubilay Lisesi adını almıştır. 1997-1998 Öğretim yılından itibaren 8 yıllık kesintisiz zorunlu ilköğretime geçilmesi nedeniyle ortaokul kısmı kademeli olarak kapatılmıştır.

              Kubilay Lisesi 01.07.2013 tarihi itibariyle Anadolu İmam Hatip Lisesi´ne dönüştürülmüştür.

             24 Ocak 2020'de meydana gelen deprem sonucu okul binası hasar görmüş ve yıkım kararı alınmış, Kubilay Anadolu İmam Hatip Lisesi geçici olarak Orhangazi Ortaokulu binasına taşınmıştır. Halen eğitim- öğretim faaliyetini burada devam ettirmektedir.

            Yıkılan Kubilay Anadolu İmam Hatip Lisesi binasının yerine 24 derslikli, 1 adet kütüphane, 1 adet çok amaçlı salon, 1 adet bilgisayar laboratuvarı, 1 adet müzik atölyesi, 1 adet görsel sanatlar atölyesi,1 adet spor salonu, 1'er adet fizik, kimya, biyoloji laboratuvarı, 1 adet erkek uygulama mescidi,1 adet kız uygulama mescidi ve 1 adet yemekhanesi bulunan modern bir bina yapılmıştır. Yeni yapılın okul binası 6 Şubatta yaşanan depremler nedeniyle Battalgazi İlçe Milli eğitim Müdürlüğü ve Malatya Adliyesince kullanılmaktadır.

              Kubilay Anadolu İmam Hatip Lisesi çok yakın bir zamanda yeni modern binasında hizmet verecektir.

               İlk yapılan bina Malatya'nın Çarmuzu semti, Turgut Temelli Caddesi 118 numarada bulunmakta iken, belediyenin yaptığı dönüşümle yeni adresi; İskender Mah. T. Temelli Cad. No;92/1 Battalgazi/Malatya olmuştur.     

1965 yılından itibaren okulumuzda görev yapan müdürlerimiz